《意见》提出，今年全省科技创新工作的主要目标是推动具有海南特色的区域创新体系建设取得重要进展，巩固海口市创新型城市建设成效，全面启动三亚市创新型城市创建工作，全面提升科技治理能力，初步建立有利于开放创新的科技创新管理制度和国际科技合作机制，健全国际化高端人才引进机制。同时推动“重大新药创制国家科技重大专项科技成果转移转化试点”先导性项目取得实质性进展，高新技术企业增加到800家，吸引重大创新平台落户海南，持续加大科技研发，使得科技成果转化率明显提升，以科技助力脱贫攻坚完成收官之战，支撑引领海南全面建成小康社会。
《意见》明确要加强与大院大所大科学家的科技创新合作，谋划推进国家级科技创新平台建设，创新国际科技合作机制，探索海南国际离岸创新创业示范区建设，实现国际人才管理改革新突破，构建开放创新新格局。
在区域创新新布局方面，《意见》要求强化海口市创新型城市建设成效，加大对中小企业创新支持，发展壮大高新技术企业，提升高新技术产业开发区发展质量；支持三亚市积极创建创新型城市，推动三亚崖州湾科技城、互联网信息产业园、遥感信息产业园、海南信息安全基地建设，推动县域科技创新发展，用科技助力脱贫攻坚和乡村振兴。
《意见》还要求支持建设深海、南繁种业创新高地建设，推进建设文昌国际航天城航空航天创新高地、博鳌乐城国际医疗旅游先行区先进医疗技术创新高地、洋浦经济开发区建设先进制造业创新高地，支持海口高新区在“十四五”期间申报创建国家自主创新示范区，支持海南生态软件园建设数字经济创新高地，加快培育海南国家农业高新技术产业示范区。
在推动南繁种业和热带特色高效农业科技创新方面，《意见》提出探索建设种业国家实验室，协调推动国家耐盐碱水稻技术创新中心三亚总部建设等，支持更多科研院所在南繁科技城设立研究机构，开展现代种业创新研究；推进以槟榔、橡胶、椰子、沉香为代表的热带特色农业创新，围绕制约产业发展瓶颈开展技术攻关。
《意见》明确提出推动重大新药创制示范基地建设，开展公共卫生领域创新研究，支持重大传染病防治科研攻关和科研平台建设，组织实施新冠肺炎疫情防治应急科研项目。
《意见》还提出要通过推动科技计划管理改革、科研项目评审制度改革、科研项目经费管理制度改革、科技成果转化管理改革、科技监督改革和科研事业单位改革等推出制度创新新举措，提升科技创新治理水平和治理能力。
